Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms