Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Lrriq1Q0P5X1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrriq1Q0P5X1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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