Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms