Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tff1Q08423 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tff1Q08423 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tff1Q08423 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tff1Q08423 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tff1Q08423 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tff1Q08423 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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