Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms