Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms