Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms