Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms