Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Crisp3Q03402 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms