Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs2Q03350 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs2Q03350 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs2Q03350 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Thbs2Q03350 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms