Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms