Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms