Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms