Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2bQ01097 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms