Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms