Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms