Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PgrQ00175 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PgrQ00175 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms