Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tarbp2P97473 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms