Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Bop1P97452 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms