Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Lig3P97386 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lig3P97386 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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