Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf1bP97358 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms