Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms