Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms