Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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