Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf5P70191 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms