Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Acta1P68134 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acta1P68134 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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