Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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UbdP63072 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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UbdP63072 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms