Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhx1P63006 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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