Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms