Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms