Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps11P62281 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms