Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms