Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdl3P58873 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms