Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms