Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp25P57080 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp25P57080 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms