Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms