Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Defb1P56386 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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