Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Atp5eP56382 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Atp5eP56382 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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