Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms