Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ube2e3P52483 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms