Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa6P50704 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa6P50704 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa6P50704 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa6P50704 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa6P50704 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa6P50704 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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