Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SftpbP50405 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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