Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnni3P48787 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnni3P48787 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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