Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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