Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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