Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf1P39428 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf1P39428 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms