Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtlP38585 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms