Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddit3P35639 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms