Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nedd1P33215 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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