Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SsbP32067 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SsbP32067 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SsbP32067 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SsbP32067 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SsbP32067 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SsbP32067 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms